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该系统大致分为控制单元（PXI（RT）系统）和操作单元（市售PC）。
控制单元主要将刺激呈现指令信号输出到刺激呈现系统（VSG），将大脑测量指令信号输出到大脑测量系统（MRI / MEG），与此同时，开关输入信息（数字数据） ），然后输入外部测量仪器（心电图，呼吸，皮肤血流量）。另外，操作单元主要将设置文件发送到控制单元，监视执行状态，并开始/结束（中断）测量。
